Однажды программист и по совместительству хакер по кличке Нео (спящая Душа-сознание) узнаёт, что мир, в котором он провёл всю жизнь — иллюзия-голограмма, так называемая «Матрица», созданная сложнейшим суперкомпьютером (Коллективным Разумом, заставляющим Душу колесить в цикле рождения и смерти, - сансаре). 

Избранный знакомится с Морфеусом (Учителем), который показывает ему настоящий и почти полностью разрушенный реальный мир, порабощённый машинами. Нео узнаёт, что все рабы живут на основе мышления логического Эго-интеллекта, который безжалостно уничтожает Природу и заставляет людей жить как серые мышки в виртуальной реальности огромной супер реалистичной 3-D игры, копируя как клоны привычки и слова друг друга. Люди не видят реальности, а их разум утонул в играх и развлечениях.

При помощи специальной программы (meditation) Нео познаёт свои безграничные возможности по расширению сознания, он обучается благодаря Великому Учителю нечеловеческим способностям и вместе с командой из лучших бойцов сопротивления (Просветлённых Душ) делает вылазки в мир материализации мыслей, в мир Матрицы. Их цель — навсегда избавиться от власти Эго-машин (Коллективного Разума), чтобы помочь себе и другим выйти из-под влияния системы сансары. 

Говорят, что битва с ловушками Матрицы и её агентами ещё не закончена! Так кто же осознает тайну Матрицы и выйдет из-под её рабства? Это покажет время...